El Colegio Agustín Fernández IED implemento la jornada única en todas sus sedes a partir del año 2019, proceso iniciado desde el año 2016.  Se refuerzan los procesos de profundización en articulación con el plan de estudios de las áreas fundamentales, que buscan fortalecer en la comunidad educativa el desarrollo integral, y así reafirmar la creatividad y la autonomía de los estudiantes.  La jornada nocturna se abrió en el año de 1990, en el marco del programa de Educación de Adultos.  Ofrece igualmente atención a estudiantes en extra edad a través del programa de Educación Diversa y Flexible.