Es una institución pública de carácter oficial adscrita a la Secretaria de Educación del Distrito Capital de Bogotá, entidad territorial certificada. La institución da apertura a labores en el año 1963, prestando el servicio únicamente para educación básica primaria. Durante sus primeros años estuvo agregada a la Secretaría de Educación de Cundinamarca y actualmente pertenece a la SED, se encuentra en la localidad 8 o Kennedy. En el año 2000 fue aprobada la extensión a básica secundaria. En el año 2001 se inicio labores en la nueva planta física con preescolar, básica primaria y básica secundaria. En el año 2002 se integra con el CED PIO XII y adopta el nombre definitivo de IED ISABEL II. En el año 2003 con autorización previa del CADEL, se amplía la cobertura a GRADO DÉCIMO de Educación Media y actualmente tiene cobertura hasta grado ONCE. 

El Colegio Distrital Isabel II, es especialista en la inclusión educativa de niños y jóvenes sordos; lidera la inclusión educativa de población sorda o con baja audición, cuenta con un equipo de profesionales, entre docentes y apoyos especializados, con amplia experiencia en la educación de escolares sordos.